中国农业科学院甜菜研究所始建于1959年，于2003年8月并入黑龙江大学，实行黑龙江省政府与中国农业科学院共建。研究所下设遗传改良研究室、遗传资源研究室、环境资源研究室、引种区试研究室、综合办公室、开发办公室。

现有科技人员60人，其中干部47人、技术工人12人，博士6人、硕士18人，研究员9人、副研究员10人。设有6个科技创新团队：甜菜遗传改良、生物技术、甜菜综合栽培技术、植物营养、农产品质量安全与检测技术、生物质能源作物研究与利用创新团队。 主办刊物《中国糖料》是全国发行的甜菜专业期刊。国家糖料改良中心、农业部甜菜质量监督检验测试中心、国家甜菜中期种质库、中国作物学会甜菜专业委员会挂靠我院。拥有作物遗传育种硕士点和甜菜研究所博士后工作站。与美国、波兰、乌克兰、意大利、德国等国家的科研机构开展交流与合作。 主持和承担国家科技支撑计划、国家自然科学基金、“948”、“973”、“863”、国家科技基础平台项目及科技部、农业部、黑龙江省的各类重点科研项目，获得科研成果104项，省部级以上奖励成果43项。其中，甜研301获国家发明二等奖，甜研302、303、304获国家科技进步三等奖。育成甜菜品种44个，并建立了甜菜种子加工车间、储藏库、种子繁育基地、马铃薯原种和生产种基地。甜菜纸筒育苗肥、水稻壮秧剂、植物生长调节剂等都已实现产业化生产。